تأسست شفشاون عام 1471م على يد مولاي علي بن راشد كقلعة جبلية لصد التوسع البرتغالي على الساحل المغربي، وسرعان ما تحوّلت إلى ملجأ للمسلمين واليهود الفارّين من الأندلس بعد سقوط غرناطة. اشتهرت لاحقاً بجدرانها المطلية بالأزرق التي أكسبتها لقب "اللؤلؤة الزرقاء".