محققین کے مطابق بخارا کا نام سغدی لفظ “بخاراک” سے ماخوذ ہے، جس کا مطلب ہے “خوش نصیب جگہ” یا “بھلائی کی جگہ” — یہ نظریہ اس دوسرے کم مقبول نظریے سے زیادہ قابلِ قبول سمجھا جاتا ہے جو اسے سنسکرت لفظ “وہارا” یعنی “بدھ خانقاہ” سے جوڑتا ہے، جو خطے کے اسلام سے پہلے کے ماضی کی طرف اشارہ ہے۔